Nucl Acids Res:科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库!

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01-07 20:24 生物谷 (BIOONNEWS)

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日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。

图片来源:www.thoughtco.com

代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围环境之间的相互作用,理解这些化合物的产生以及彼此之间的关联,或能帮助研究人员有效评估个体机体的健康状况,并开发治疗多种疾病的新型个体化疗法。

研究人员将该数据库称为"jMorp",该数据库中包含了人类306种代谢产物和256种常见蛋白质的相关信息,这包括样本的频率、浓度及这些物质在男性或女性中或不同年龄段人群的分布表现形式;这个数据库具有一定的特殊性,其不仅能够显示原始数据,还能为访问者提供机会来阐明不同代谢产物之间的相互关联,从而为后期研究提供方法来有效鉴别代谢产物和蛋白质之间的关联。

研究者Tadaka说道,jMorp中的信息能够通过聚合单个数据创建的统计数据来获得,在开放浏览权限之前,独立委员会或许还应该仔细考虑所涉及的伦理道德问题;类似的数据库或许还能覆盖诸如英国和爱尔兰等国家,但由于不一致的数据收集或小样本比例的原因,这样的数据库或许还存在一定的局限性,向jMorp数据库提供样本信息的大量健康个体或让该数据库变得更加有用,研究人员还利用相同的方法收集信息并对其进行分析,这就能够最大限度地减少测量的误差。此外研究人员还采取了额外的措施来排除任何低质量的样本,从而就能确保在整个血液样本的收集、储存和分析过程保证样本的质量控制工作,这就能够使得jMorp数据库作为科学家尤为可靠的资源以供使用,尤其是生物化学家和医学研究人员。

为了让该数据库能对其他研究人员有用,研究人员还以一种用户友好的方式来对该数据库进行设置,从而就能使访问者顺利看到其所需要看到地信息,同时还能帮助他们进行不同化合物数据信息关系的比较,用户们也可以通过名称或规格来进行搜索,同时还能够对数据的摘要和图片信息进行下载保存。

jMorp数据库的开发是研究人员不断努力的结果,后期研究人员还将继续收集并分析更多血液样本来更新该数据库,下一步他们计划应用多种不同的分析手段来深入解读多种不同的代谢产物和蛋白质的相关重要信息。

原始出处:Shu Tadaka, Daisuke Saigusa, Ikuko N. Motoike, et al. jMorp: Japanese Multi Omics Reference Panel. Nucleic Acids Research, 2017; DOI: 10.1093/nar/gkx978

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